Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
XylbQ3TNA1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
XylbQ3TNA1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms