Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc162pQ0VG85 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms