Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cntnap5bQ0V8T8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms