Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ubxn2bQ0KL01 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms