Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnma1Q08460 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnma1Q08460 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms