Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gata4Q08369 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms