Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tgm3Q08189 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tgm3Q08189 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms