Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cnn2Q08093 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cnn2Q08093 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cnn2Q08093 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Cnn2Q08093 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cnn2Q08093 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cnn2Q08093 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cnn2Q08093 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cnn2Q08093 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cnn2Q08093 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Cnn2Q08093 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cnn2Q08093 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms