Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pou6f1Q07916 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pou6f1Q07916 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms