Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AmbpQ07456 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms