Protein–RNA interactions for Protein: Q06335

Aplp2, Amyloid-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aplp2Q06335 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Aplp2Q06335 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms