Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Caprin2Q05A80 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Caprin2Q05A80 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms