Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Col6a1Q04857 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Col6a1Q04857 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms