Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Top1Q04750 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Top1Q04750 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms