Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ddr1Q03146 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms