Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gjb4Q02738 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gjb4Q02738 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms