Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EgfrQ01279 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EgfrQ01279 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms