Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pde1bQ01065 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pde1bQ01065 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms