Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gjb2Q00977 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms