Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabpaQ00422 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabpaQ00422 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabpaQ00422 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabpaQ00422 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabpaQ00422 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GabpaQ00422 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GabpaQ00422 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms