Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pitx2P97474 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms