Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas2P97460 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas2P97460 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms