Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SmsP97355 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SmsP97355 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SmsP97355 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SmsP97355 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SmsP97355 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmsP97355 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmsP97355 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SmsP97355 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SmsP97355 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmsP97355 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmsP97355 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmsP97355 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SmsP97355 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SmsP97355 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmsP97355 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmsP97355 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmsP97355 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmsP97355 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmsP97355 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmsP97355 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmsP97355 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmsP97355 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmsP97355 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SmsP97355 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SmsP97355 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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