Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Pkp1P97350 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pkp1P97350 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms