Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43bP86448 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim43bP86448 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms