Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vgll3P85442 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vgll3P85442 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms