Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tubg1P83887 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tubg1P83887 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms