Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx3P81067 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx3P81067 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms