Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irx2P81066 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms