Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ptprn2P80560 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ptprn2P80560 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ptprn2P80560 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ptprn2P80560 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ptprn2P80560 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ptprn2P80560 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptprn2P80560 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ptprn2P80560 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms