Protein–RNA interactions for Protein: P70451

Fer, Tyrosine-protein kinase Fer, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FerP70451 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FerP70451 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FerP70451 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FerP70451 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FerP70451 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms