Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gfi1P70338 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gfi1P70338 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms