Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NficP70255 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NficP70255 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NficP70255 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NficP70255 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms