Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Traf6P70196 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Traf6P70196 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Traf6P70196 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms