Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Sumo1P63166 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms