Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rps11P62281 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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