Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Itga11P61622 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Itga11P61622 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms