Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Ube2d1P61080 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ube2d1P61080 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms