Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ripk2P58801 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ripk2P58801 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms