Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm2P58774 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms