Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtnsP57757 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CtnsP57757 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CtnsP57757 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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