Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TdgP56581 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TdgP56581 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TdgP56581 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TdgP56581 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms