Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PctpP53808 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PctpP53808 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PctpP53808 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PctpP53808 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PctpP53808 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PctpP53808 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PctpP53808 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PctpP53808 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms