Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RabggtbP53612 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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RabggtbP53612 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RabggtbP53612 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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