Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SftpdP50404 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms