Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Epb41P48193 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms