Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cdkn1bP46414 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms