Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tnfsf9P41274 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Tnfsf9P41274 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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