Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Mmp9P41245 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Mmp9P41245 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mmp9P41245 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mmp9P41245 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mmp9P41245 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Mmp9P41245 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Mmp9P41245 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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