Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lig1P37913 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lig1P37913 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms